Diversité et évolution des caféiers à la lumière de la génomique

Auteurs

    Philippe Lashermes
    Marie-Christine Combes
    Alexis Dereeper
    Alberto Cenci

DOI :

https://doi.org/10.1684/agr.2012.0555

Mots-clés


biodiversité, évolution, génome, polyploïdie, séquence nucléotidique

Résumé

Les caféiers présentent une diversité considérable en termes de morphologie, de phénologie et d'adaptation écologique. Différentes études moléculaires ont été entreprises afin de préciser l'histoire évolutive du génome des caféiers ainsi que la phylogénie et les modalités de diversification du genre Coffea. Ainsi, il apparaît que les espèces de caféiers résultent d'une explosion radiative récente. Une faible divergence nucléique ainsi qu'une quasi parfaite colinéarité au niveau des gènes sont observées entre espèces. Les modalités de régulation de l'expression des gènes joueraient un rôle central dans la diversification des caféiers. Des analyses suggèrent que les Astéridées (par exemple les caféiers) et les Rosidées (par exemple la vigne) dérivent d'un même génome ancestral paléohexaploïde, et qu'aucun événement de duplication globale n'aurait eu lieu ultérieurement au cours de la lignée évolutive conduisant aux caféiers. Ces nouvelles connaissances permettent de nouvelles stratégies pour l'identification de gènes d'importance agroéconomique, et devraient conduire à une plus grande efficacité des programmes d'amélioration.

Affiliations

IRD UMR RPB (Cirad, IRD, université Montpellier II) BP 64501 34394 Montpellier cedex 5 France

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Publié

2012-03-01

Comment citer

Lashermes, P., Combes, M.-C., Dereeper, A., & Cenci, A. (2012). Diversité et évolution des caféiers à la lumière de la génomique. Cahiers Agricultures, 21(2-3), 134–142 (1). https://doi.org/10.1684/agr.2012.0555

Numéro

Rubrique

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