Profils de séquences répétées en tandem (SSR) pour la variété d'agrume Limau Madu (Citrus reticulata Blanco) cultivée en Malaisie.

Résumé

Introduction. En Malaisie, la variété d'agrume Limau Madu (Citrus reticulata Blanco ; Citrus suhuiensis Hort. ex Tanaka) est commercialement cultivée pour la consommation locale. C'est une mandarine facile à peler, avec un fruit de forme sphérique et une peau de couleur vert-brillant ou jaune-verdâtre. En Malaisie, la variété Limau Madu est propagée végétativement, de ce fait on présume qu'elle a une variabilité minimale. Dans notre étude, la variabilité génétique et la parenté génétique d'accessions de Limau Madu ont été évaluées parmi des échantillons cultivés et collectés dans différents états de la Malaisie, en utilisant des amorces de séquences répétées en tandem (SSR). Matériel et méthodes. Trente paires d'amorces de SSR dérivées de Citrus unshiu ont été examinées et 22 paires d'amorce de SSR ont été employées pour évaluer la variabilité génétique et la parenté parmi 118 échantillons de Limau Madu cultivés. Résultats et discussion. Le pourcentage de la transférabilité de SSR de C. unshiu vers C. reticulata (Limau Madu) a été de 73,33 %, ce qui indiquerait que les séquences d'amorce encadrant les séquences répétées en tandem ont été préservées parmi les espèces d'agrumes. La plupart des loci de SSR ont révélé un grand excès d'hétérozygotes. Dans notre étude, une faible diversité allélique a été enregistrée avec une moyenne de 5,227 allèles par locus. La valeur de l'information polymorphe a varié de 0,048 à 0,674. En se basant sur l'analyse des classes par la méthode UPGMA, quatre groupes ont été identifiés à partir de ces génotypes d'agrume avec une distance génétique moyenne de 0,170. La faible variabilité génétique au sein de l'espèce pourrait être attribuée soit à la multiplication végétative soit à l'incapacité de détecter des différences parmi des échantillons en utilisant nos amorces.(Résumé d'auteur)