Marquage par AFLP, RAPD et RFLP pour la construction de cartes génétiques de Citrus aurantium et C. latipes

Résumé

Introduction. Les agrumes ont, à l'échelle mondiale, une grande importance économique. Leur sélection est longue du fait de la durée de leur période juvénile, de leur hétérozygotie et de l'embryonnie nucellaire. Les techniques de marquage moléculaire sont un outil important pour identifier les régions chromosomiques portant les loci des caractères agronomiques importants et pour effectuer une sélection, assistée par marqueurs, de porte- greffes d'agrumes. Ils ont donc été utilisés pour la construction de cartes de linkages pour #C. aurantium# and #C. latipes#. Matériel et méthodes. L'évaluation du polymorphisme de 50 individus F1, issus d'un croisement entre #C. latipes# et C. aurantium, a été faite à partir de l'étude par marqueurs AFLP (sept combinaisons d'amorces EcoRI/MseI), RADP (280 amorces) et RFLP (50 sondes isolées d'une bibliothèque génomique de PstI d'agrumes). Les marqueurs ont été identifiés en utilisant une stratégie de pseudo-testcross et deux cartes de linkage l'une pour #C. latipes# l'autre pour #C. aurantium# ont été construites en utilisant un logiciel adapté. Résultats et discussion. Pour C. latipes, 110 marqueurs de ségrégation (60 AFLP, 46 RAPD et 4 RFLP) ont été identifiés. Parmi eux, 92 ont formé 12 groupes de linkage (7 principaux et 5 mineurs) couvrant 600 cM, alors que 18 marqueurs sont restés non liés. Pour C. aurantium, 268 marqueurs de ségrégation (144 AFLP, 111 RAPD and 13 RFLP) ont été identifiés, dont 247 ont formé 20 groupes de linkage (10 majeurs et 10 mineurs) couvrant 1000cM, tandis que 21 marqueurs restaient non liés. L'étude d'un plus grand nombre d'individus apparaît nécessaire pour augmenter la fiabilité de la carte obtenue et entreprendre l'analyse des loci des caractères quantitatifs (QTL).