Utilisation de sites étiquetés par leur séquence pour esquisser la structure génomique du chloroplaste de banane

Résumé

Cartographier le génome de la banane est obligatoire pour définir des stratégies de sélection moléculaire. Chez les plantes supérieures, l'information génétique est localisée dans les génomes chloroplastiques, mitochondriaux et nucléaires. Le génome chloroplastique (Gc), le moins complexe, est couramment utilisé en biologie moléculaire. Pour la banane, l'utilisation des techniques de RFLP a révélé plusieurs groupes chloroplastiques dans les types sauvages et cultivés, mais les études antérieures ont donné des informations insuffisantes sur la structure du chromosome chloroplastique. Ce document expose les principaux éléments connus de la structure générale du chloroplaste des Musa. La structure du GC de la banane a été explorée à partir de huit sondes correspondant à des sites étiquetés par leur séquence (STS) homologues et de cinq paires d'amorces "universelles". Du fait de deux régions, répétitions inversées (RI), détectées et des homologies de séquence, la taille du chromosome chloroplastique de la banane serait de 150 kb. De nouvelles données suggèrent que le chloroplaste de la banane, bien que proche, n'est pas fortement apparenté aux plantes herbacées. L'analyse de séquences non codantes en 5' de gènes chloroplastiques et l'usage de codons indiquent qu'une transcription différenciée a pu subvenir chez la banane et le riz. Globalement, une collection de 11 sondes RFLP de banane, couvrant uniformément le génome chloroplastique (14 loci) est utilisable