Quels bénéfices la génomique peut-elle apporter à la viticulture ?

Résumé

La vigne est une espèce majeure pour l'agriculture française. Afin d'accroître sa compétitivité économique et d'adapter sa culture aux nouvelles contraintes de production qui résultent du changement climatique, de l'émergence de nouvelles maladies, des impératifs de protection de l'environnement et des comportements des consommateurs, il est nécessaire d'approfondir les connaissances sur son fonctionnement physiologique dans son environnement. Dans cet objectif, des outils génomiques ont été développés, sous l'égide du consortium international (International Grape Genome Program-www.vitacea.org:8080), créé en 2001. En particulier, son génome est actuellement séquencé dans le cadre d'un projet public franco-italien (www.cns.fr). La connaissance du génome de la vigne favorisera considérablement le transfert des résultats des espèces modèles vers la vigne tout en tenant compte de ses spécificités biologiques. Elle permettra également des approches de génomique fonctionnelle à grande échelle et sans a priori qui ont montré leur richesse et leur efficacité pour l'étude de caractères complexes chez d'autres espèces. Ces outils génomiques pourront être intégrés dans des approches génétique, physiologique et écophysiologique dans le but par exemple de développer des stratégies efficaces de sélection assistée par marqueurs de variétés résistantes aux maladies ou bien encore des modèles de prédiction du fonctionnement de la plante au champ pour une viticulture plus précise et plus durable. Les verrous importants qui devront être levés dans le futur concernent le développement d'outils pour la validation de la fonction des gènes dans ce système biologique et l'intégration des connaissances fondamentales qui vont être obtenues en modèles prédictifs. Enfin, il est important d'organiser les systèmes d'appels d'offres et de financements de façon à permettre la mise en oeuvre sur le long terme d'une recherche efficace depuis le secteur public jusqu'à la valorisation dans le secteur privé.